Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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