Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rpl35aO55142 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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