Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NlkO54949 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NlkO54949 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NlkO54949 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NlkO54949 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms