Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarce1O54941 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarce1O54941 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarce1O54941 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarce1O54941 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarce1O54941 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarce1O54941 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarce1O54941 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms