Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms