Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek2O35942 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms