Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Opn1mwO35599 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Opn1mwO35599 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Opn1mwO35599 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Opn1mwO35599 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Opn1mwO35599 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Opn1mwO35599 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Opn1mwO35599 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Opn1mwO35599 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Opn1mwO35599 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Opn1mwO35599 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Opn1mwO35599 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn1mwO35599 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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