Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Scarb2O35114 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Scarb2O35114 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms