Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms