Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sypl1O09117 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sypl1O09117 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl1O09117 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl1O09117 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl1O09117 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl1O09117 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl1O09117 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl1O09117 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl1O09117 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl1O09117 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl1O09117 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl1O09117 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sypl1O09117 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sypl1O09117 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms