Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gcm2O09102 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gcm2O09102 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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