Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eftud2O08810 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms