Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sec22bO08547 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sec22bO08547 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sec22bO08547 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec22bO08547 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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