Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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