Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21310J3QQ23 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms