Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm2056J3QQ02 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm2056J3QQ02 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms