Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm8888J3QPX5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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