Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms