Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm20795J3QP49 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm20795J3QP49 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm20795J3QP49 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm20795J3QP49 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm20795J3QP49 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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