Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim18J3QNP2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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