Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
4930544D05RikJ3QK56 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms