Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20830J3KML6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20830J3KML6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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