Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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