Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Raph1F2Z3U3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Raph1F2Z3U3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms