Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nolc1E9Q5C9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nolc1E9Q5C9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms