Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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