Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms