Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Srp54bE9PXC0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Srp54bE9PXC0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Srp54bE9PXC0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Srp54bE9PXC0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Srp54bE9PXC0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Srp54bE9PXC0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Srp54bE9PXC0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54bE9PXC0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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