Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3002E9PW72 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms