Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms