Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3259D3YUK0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3259D3YUK0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3259D3YUK0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm3259D3YUK0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm3259D3YUK0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm3259D3YUK0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm3259D3YUK0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm3259D3YUK0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms