Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol6B7ZC55 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms