Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms