Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms