Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms