Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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