Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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