Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms