Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11127A7VMS2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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