Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2c2A7L9Z8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2c2A7L9Z8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2c2A7L9Z8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2c2A7L9Z8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atp2c2A7L9Z8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp2c2A7L9Z8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms