Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp4A4UUI3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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