Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms