Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5640A3KG49 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms