Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms