Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930447F04RikA2AFR2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms