Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef6A2A8M8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms