Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms