Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms