Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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