Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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